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웨스턴 블 롯팅은 생화학 실험실에서 가장 일반적인 절차 중 하나입니다. 기본적으로 샘플에서 단백질을 크기별로 분리 한 다음 항체를 사용하여 테스트하여 주어진 단백질이 있는지 확인합니다. 연구뿐만 아니라 의료 또는 진단 실험실에서도 유용합니다. 예를 들어, HIV 및 라임 질환 둘 다에 대한 시험은 ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay) 시험에 이어 ELISA가 양성인 경우 웨스턴 블롯을 수행한다. 그러나 그 인기에도 불구하고 웨스턴 블로 팅에는 몇 가지 단점이 있습니다.
비 정량
고전적인 서양 얼룩은 비 정량적입니다. 즉, 특정 단백질이 있는지 여부를 연구원에게 알릴 수는 있지만 단백질의 양을 정량화 할 수는 없습니다. 일부 생명 공학 회사는 현재 연구원이나 실험실 기술자가 표준 곡선을 사용하여 존재하는 단백질의 양을 정량화 할 수있는 키트를 판매하지만 이는 동일한 단백질의 순수한 샘플을 사용할 수있는 경우에만 작동합니다. 또한, 단백질의 분자량은 질량 분석법으로 정확하게 측정하기보다는 웨스턴 블 롯팅으로 만 추정 할 수 있습니다.
항체
웨스턴 블롯은 관심있는 단백질에 대한 1 차 항체가 이용 가능한 경우에만 수행 될 수있다. 많은 다른 단백질에 대한 항체는 생명 공학 회사에서 구할 수 있지만 저렴하지는 않습니다. 주어진 단백질에 대해 1 차 항체를 사용할 수없는 경우 해당 특정 단백질을 찾는 Western blot을 수행 할 수 없습니다. 또한 연구자들은 단백질이 인산화 된 경우 (예 : 인산염 기가 부착 된 경우) 단백질이 변형되었는지, 웨스턴 블롯 기술을 통해 변형 된 단백질에 특이적인 항체가 필요한지 여부를 확인할 수 있습니다. 단백질.
훈련
Western blot을 올바르게 수행하고 좋은 결과를 얻는 것은 어려울 수 있으므로 직원은 잘 훈련되어야합니다.다른 많은 경우와 마찬가지로이 경험은 아마도 최고의 교사 일 것입니다. 그러나 숙련 된 기술자라도 Western blot은 시간이 많이 걸립니다. 예를 들어, 실험의 겔 전기 영동 부분은 전형적으로 작동하는데 1 시간 내지 2 시간이 걸릴 것이다. 물론 젤이 작동하는 동안 다른 작업을 수행 할 수 있지만 실험 결과는 아직 시간이 많이 걸립니다.
다른 한계
항체는 때때로 일부 오프-타겟 바인딩을 보여 결과가 나빠질 수 있습니다. 또한 Western blotting에서는 특정 단백질에 대한 항체를 사용하므로 해당 단백질이 있는지 여부 만 결과로 알려줍니다. 대조적으로, 고분해능 질량 분석법은 샘플에 존재하는 모든 단백질을 나타내며, 고전적인 웨스턴 블 롯팅과 달리 정량적입니다. 물론 질량 분석법은 웨스턴 블 롯팅에 비해 훨씬 비싸고 기술적으로 사용하기가 더 어렵다는 것을 기억하는 것이 중요합니다.